メタルギアソリッドV TPPのストーリーについて。 ややこしくてよく分からないので教えて下さい。

サイファー＝ゼロ率いる「愛国者達」ですよね。スカルフェイス率いるXOFはサイファーの軍事部隊ですが、スカルフェイスは独自の判断でゼロの言うことを聞かない。

でグラウンドゼロズの段階で、スカルフェイスは勝手にマザーベースを強襲、壊滅し、スネークも殺そうとしました。

ここで疑問。
ゼロの目的はスネークをサイファーの軍事力として巻き取ることでした。
しかしスカルフェイスの目的はスネーク一団を壊滅することでした。なぜスカルフェイスはスネークを殺したいのでしょう？

しかもスネークがサヘラントロプスの手に捕まった時、スカルフェイスはスネークを殺さず逃しました。その理由もよくわかりません。
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