METAL GEAR SOLID INTEGRAL

先に言っておくと、現在のMGSシリーズと初代MGとMG2は公式に別物扱いになっている。
これはシリーズ長期化で設定に不整合が出たため。
あくまでMGSシリーズにとってのMG1とMG2は「大体そんな話があった」程度の扱い。
具体的に言うとスネークが自身の親でもあるビッグボスと親友でもあったグレイフォックスを倒したくらいの部分しか受け継がれていない。

・MGS3
初代スネークもとい後のビッグボスがミッションで恩師を殺し、その原因が自国にあったと知り、最後には国への愛想を尽かす話。
この後、ビッグボスはアメリカの兵士としてではなく、個人で各国を放浪、傭兵になる。この傭兵時代のエピソードがMGS5になる。

・MG1
傭兵時代を経て、その能力を買われたビッグボスはアメリカの特殊部隊FOX HOUNDの司令官の座につく。
そこで諜報員として育てられたソリッドスネークは最終兵器メタルギアの破壊をビッグボスに命じされ、アウターヘブンに単独潜入する。
その先で出会ったのは、実はメタルギアを作り、アウターヘブンを組織したのがビッグボスという事実と判明、さらにスネークはボスのクローンだと明かされる。
戦いの中でスネークはボスを倒し、帰還する。

・MG2
アウターヘブン事件後、スネークは新たな任務で中東のザンジバーランドに潜入する。
そこでスネークは新しいメタルギアを発見、さらに倒したはずのビッグボス、そして同僚にして親友だったグレイフォックスが敵として立ちふさがる。
新型メタルギアの破壊、そして今度こそビッグボスを倒し、最後にスネークは地雷原の中でグレイフォックスと戦う。
すべての戦いを終わらせ、スネークは帰還する。

ザンジバーランド事件後、スネークはFOX HOUNDを除隊し、アラスカの僻地で一人静かに隠遁生活を選ぶ。
が、その後に再びFOX HOUNDに招集され、新たな任務につくのがMGS1のエピソード。