ポケットモンスターX

空白の時間が計算されていないのが原因だと思いますよ。

DSメニューでゲームソフトを選んでから、実際にゲームが起動するまでにソウルシルバーだと6秒前後の時間が入ります(通称、空白の時間です)。
この時間の間はフレームが進まないので、時間計算の際には足さないといけないのです。

時間設定
→間10秒
→ゲーム起動
→空白の時間6秒前後が入る
→フレーム1589-年数の時間が入る
→続きから始めるを選択
という風になります。

なので…フレーム1589から年数29を引くと1560フレームになりますが、青パネルの結果ではフレームは1202しかありませんと。
差分358だけ時間が足らないのです。

ところでフレームは60につき実際の1秒になるのですが、358(ほぼ360)は約6秒ですよね？
つまり、空白時間の6秒を足せばフレームは合ってきます。

※ゲーム起動を6秒早くすることは時間的には無理なので、続きから始めるを選択する時間を6秒遅くすれば良いですが…
月日分秒の合計を満たさなくなってしまうので、113を保つためにも「分」を6秒減らしましょう。

もう一つ違いがあり、質問者さんの計算で分＋秒は43のはずですが…青パネルの結果では分＋秒は42とあります。ようするに計算とは裏腹に実際は1足りていないということです。
ですが対策は簡単で、分を1足せば解決します(今回、月日分秒の合計は113ではなく114にすれば合うということですね)。

結果
2029年10月7日13時7分10秒に選択、26秒後の36秒に続きから
→これを変更で…
2029年10月7日13時2分10秒に選択→32秒後の42秒に続きから
これで目標周辺が出てくると思います。

このように初期SEED合わせは青パネルの結果から簡単に合わせることが出来るのです。