パズル＆ドラゴンズ

質問にそのまま回答するならば、エキドナが直接ドロップするダンジョンはありません。
ナーガが落ちる可能性があるダンジョンは以下です。

ウルカヌ火山（炎の蛇女）
ネルヴァ灼熱林（火を祀る蛇）
陽炎の塔（炎と光の舞）
森羅の塔（火中の大輪）
ヒュペリオ溶岩河（炎に愛された蛇）
ヴェスティーア大空洞（灼熱の地底湖）
プローセル凍土（氷ついた城）
マルースクレーター（星降りの樹海）
伝説龍の足跡（灼熱地獄）
天空龍の領域（緋天の空）
歴龍の大魔境（蒼き孤島 火水木）
伝説の炎龍（超級・上級）
炎の天空龍（上級・超級）
焔の機械龍（上級）
炎の歴龍（上級・超級)
水の歴龍（上級・地獄級)
アンケートダンジョン4

パズル＆ドラゴンズ非公式wiki 【パズドラ】
モンスター図鑑 No.088 ナーガ
http://www18.atwiki.jp/pazdra/pages/1236.html


ですが、スキル上げをする目的なら、
○アンケートダンジョン4
ここ1択です。
他はスキル上げに使えるほど頻繁には落ちません。