ふと気になったので質問します。

２つの物語は各々にセーブデータを分けなければ保存されないのでしょうか？
僕は今、同時進行でやってるのですが、データは２つに分けています。

１つのデータで２人の主人公を保存する事は出来るのでしょうか？
試そうと思えば出来るのですが、どちらも割と進んでしまっているので現状恐くて出来ません。
御存知の方は解答お願いします。