とうぞくと1000びきのポケモン

一度に来る量が決まってるので、すでにすれ違いで来ていたポケモンと合わせた残りは溢れてしまったのでしょう。

不確定で申し訳ありませんが、なんとなくわかっていること書きますね。
参考程度と考えてください。
当方5台の3DSで遊んでいます。
ケロマツ2台、フォッコ2台、ハリマロン1台です。
最後にクリアしたステージの最大で連れて行けるポケモンの数が関係していると思います。
たとえば7ステージのライオット やるきなし！？ではそれぞれ110匹連れて行けます。
そこをクリアして終了すると、すれちがい時110匹来ました。
またステージ1ぼうけんの はじまりをクリアした状態で終了したときは20匹しか来ませんでした。
ステージ12とうぞくの おかしな こぶんでは220匹来ました。
また全滅してなかまのかずが0匹のときは1匹しか来なかったです。
全滅したときのなかまのかずが残っていた場合の状態は未検証です。

とにかく私はなかまの数が多い状態で、さらにバトルに勝った状態で終了することを心がけています。
勝って終わることが重要と思っています。

特にステージ7は超簡単で、草と水がいればクリア可能です。
ハリマロン、ケロマツを110匹、予備でフォッコは10?20匹程度連れて行けばたいていクリアできます。
ここで終了しておけば、おそらく110匹すれちがえる（あげることができる）と思います。
10面も簡単で、草20くらい、火140、水140でクリア可能。ここなら140匹。
また11面も7面よりは難しいですが比較的簡単です。
草130、火200、水130（心配なら150,200,150）でクリアできます。
ここなら200匹あげれますよ。

あと、負けたあとコインで追加したポケモンはノーカウントでした。
なので負けた→コインで200匹呼んだ→仲間の数は200になった→
この場合、追加した200匹はすれちがいで来てくれなかったです。
貴殿と話されていることは、コレかと思います。
あ、勝った後、コインで追加してもその分は来なかった気がします。
つまり1ステージクリアのあと、最後にコインで追加した数はすれちがってくれなかったので「あれ？なんで？」と思ったことがあります。
追加するならバトルの前に増やしておく、これが賢明かと思います。
私はそうしています。
でも結局、最後にクリアしたステージの連れて行ける仲間の数になってしまう感じですが。

先のステージで勝って終了コレかと思います。

ちなみになかまのかずが最大数であっても、すれちがえる数は上記になるようです。
進んだ面が13ステージまでだと、1種類の最大数720匹となります。
すでに720匹いても、すれちがった相手が11面をクリアして終わっている状態であれば200匹くれました。
ただ720匹頭打ちですから、それ以上は増えませんね。

もう一度断っておきますが、まだ不確定ですので参考程度にどうぞ。

たぶんこれです。でも参考程度に見てください。

最後にバトルして勝った時に連れて行ったリーダーキャラのポケモンの数。

バトル後の残った数や控えの手持ちの数ではなく、（たくさんあげたいのなら）勝利が条件で、そのバトルに連れて行ったメインポケモン（リーダーキャラ）の数＝すれちがいで与える数だと思います。

簡単に言えば、メインキャラをたくさん連れて行ってバトルに勝って終わらせると連れて行った数だけあげられる、これだと思います。
または勝ち以外なら、どんな状態（全滅or引き返す）でバトルを終わらせたか（これはあまり自信無いなぁ）

当方5台の3DSで遊んでいます。
ハリマロン1台、フォッコ2台、ケロマツ2台。（台数は関係有りませんが）

?事例?
ケロマツリーダー機での出来事。
ステージ13 めざすは あおい かがやき。
このステージは水ポケモンがいなくてもクリア可能です。
草240、火240、水30でクリアできます。
よって上記のポケモンの数で難なくクリアしました。
するとこの3DSとすれ違った他の3DSには30匹のケロマツが渡りました。
改めてステージ13を草240、火240、水240にして出撃→クリア。
するとこの3DSとすれ違った他の3DSには240匹のケロマツが渡りました。
全滅した場合、1匹でした。

上記が正論だとすると、おそらく貴殿の200匹持ってたのに3匹だったというのは以下と考えます。もちろんリーダーはケロマツ。
まずなかまをつれて出撃、負けそうになり一旦引き上げ、その際残ったケロマツは3匹だった。その後、ゲームコインでケロマツを追加して手持ちを200匹まで回復させた。（この場合3匹残った状態でバトルを終わらせたことになりますね。だから3匹）確証はありませんが。


ちなみになかまのかずが最大数であっても、すれちがえる数は上記になるようです。
進んだ面が13ステージまでだと、1種類の最大数720匹となります。
すでに720匹いても、すれちがった相手が11面をクリアして終わっている状態であれば200匹くれました。
ただ720匹頭打ちですから、それ以上は増えませんね。

ショップ⇒ジュエルショップ下の方⇒島ヒロビーロジュエル5個

電波人間のrpg Freeでわジエルショップで5jでかえます(笑)(泣)

ステージ８のレベル40の
「ウインドフライ」を倒したあとの
宝箱で手に入ります（今日手に入りました（８/６））

島ヒロビーロはステージを進めて宝箱を開ければ入手できます

例外として、ステージ4をクリアするとジュエルショップで1個だけ購入出来ます

貫通ホーミングはホーミング弾が相手に当たるとそのまま貫通してダメージを与え、弧を描いてその貫通したホーミング弾がまた相手に当たるという感じですね。
すごい説明しづらいので、実際使って見た方がわかりやすいですよ。