星のカービィ Wii

ニンジャはクナイ手裏剣を遠距離から、素早く、連発できることに魅力があると思います。
威力が低くても連続して当たれば問題ありませんし、ファイターと違って空中にいる敵にもそれができます。
はたき切り〜返し四連は威力が高い上、これも空中でできて便利です。
また、ファイターのスピンキックには攻撃が出るまでに少し間があるので、タイミングが遅れると無敵になるまでに攻撃されてしまい、ダメージを食らうといった危険もあります。
ニンジャのいあい抜きの場合、素早く出せますし、スピンキックと違って連続ヒットさせることができます。
さらに、いずな落としは威力が高く、空中でも出せるというメリットがあります。
ファイターのライジンブレイクは無敵ですが、敵に突っ込んでしまう恐れがあるというのに対し、いずな落としは無敵、且つ威力が高く、一度下まで戻るので敵に突っ込んでしまう恐れはありません。

つまり、ニンジャは素早い攻撃が多く、臨機応変に攻撃でき、隙を狙って大技を決めていくファイターよりも使い勝手が良いです。

ファイターは速攻メガ波導ショットやライジンブレイクをうまく使えるのなら、ぜんぜん良いと思います。
ただ、ファイターのような大技を決めていく能力よりも、ニンジャのような素早く、臨機応変に戦っていく能力の方が得意という方もいらっしゃるので
「ファイターの方がニンジャよりも良い」
とは言い切られないと思います。