取り返しのつかない要素

•ストーリー途中で離脱する旧雷門メンバー
風丸、染岡、栗松、マックス、半田、宍戸、影野、少林は、
クリア後の再加入時に、離脱前に秘伝書で覚えさせた技、特訓で底上げしたパラメータ、必殺技の改や真への強化が無効となっています。
特に、風丸、染岡、栗松に、一個しかない秘伝書「メガトンヘッド」を覚えさせてしまうと、無駄になってしまう。
•外すことのできない固定メンバーは育成のやり直しがきかない。
•真・帝国学園、研究所MAPはクリアすると入れなくなるので、宝箱回収は忘れずに。
•プレミアム対戦で低確率ドロップできるため、全く取り返しがつかないわけではありませんが、スキル系の技（○○プラスなど）は漫遊寺中での必殺技伝承ができないため、秘伝書が実質使い捨てとなっています。秘伝書１つにつき１キャラクターにしか覚えさせることができないので、慎重に使用してください。
•メガトンヘッドなど1つしかない秘伝書を漫遊寺中での必殺技伝承をしないで
新たな必殺技を上書きすると無くなってしまうので注意しましょう。