クリア後

【裏ゼルダモード追加】

・基本的な進行は変わらないが、全てが反転した鏡写しの世界になっている。
・各ダンジョンの謎解きが一新、さらに難易度の高い謎解きになっています。
・敵から受けるダメージが2倍。

【ボスチャレンジモード】

・森の神殿クリア後から、コキリの森のリンクの家で挑戦できるようになります。
　過去に戦ったことのあるボスと再度戦うことができるモード。

・全てのボスをクリアしたあとは連戦モードが追加され、
　ゴーマからツインローバまで一気に戦うことになります。
・連戦モードではライフの初期値が5つでスタートとなり、
　ボスを倒すごとに2つのうち1つの宝箱を開けて進んでいきます。
　宝箱にはハートの器か、戦闘に使えるアイテムどちらかが入っています。
　これらのアイテムはその連戦時のみ有効です。

・クリアするとタイムが記録される。特にこれといった特典は無いです。